Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Pan3Q640Q5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Pan3Q640Q5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pan3Q640Q5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pan3Q640Q5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pan3Q640Q5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pan3Q640Q5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pan3Q640Q5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pan3Q640Q5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pan3Q640Q5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pan3Q640Q5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pan3Q640Q5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pan3Q640Q5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pan3Q640Q5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pan3Q640Q5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pan3Q640Q5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pan3Q640Q5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pan3Q640Q5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pan3Q640Q5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pan3Q640Q5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pan3Q640Q5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pan3Q640Q5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Pan3Q640Q5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pan3Q640Q5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pan3Q640Q5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pan3Q640Q5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pan3Q640Q5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pan3Q640Q5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pan3Q640Q5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pan3Q640Q5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pan3Q640Q5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pan3Q640Q5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pan3Q640Q5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pan3Q640Q5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pan3Q640Q5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pan3Q640Q5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pan3Q640Q5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pan3Q640Q5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pan3Q640Q5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pan3Q640Q5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pan3Q640Q5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pan3Q640Q5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pan3Q640Q5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pan3Q640Q5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pan3Q640Q5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pan3Q640Q5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pan3Q640Q5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pan3Q640Q5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pan3Q640Q5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pan3Q640Q5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pan3Q640Q5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pan3Q640Q5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pan3Q640Q5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pan3Q640Q5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pan3Q640Q5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pan3Q640Q5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pan3Q640Q5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pan3Q640Q5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pan3Q640Q5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pan3Q640Q5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pan3Q640Q5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pan3Q640Q5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pan3Q640Q5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pan3Q640Q5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pan3Q640Q5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pan3Q640Q5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pan3Q640Q5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pan3Q640Q5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pan3Q640Q5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pan3Q640Q5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pan3Q640Q5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pan3Q640Q5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pan3Q640Q5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pan3Q640Q5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pan3Q640Q5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pan3Q640Q5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pan3Q640Q5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pan3Q640Q5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pan3Q640Q5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pan3Q640Q5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pan3Q640Q5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pan3Q640Q5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pan3Q640Q5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pan3Q640Q5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pan3Q640Q5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pan3Q640Q5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pan3Q640Q5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pan3Q640Q5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pan3Q640Q5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pan3Q640Q5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pan3Q640Q5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pan3Q640Q5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pan3Q640Q5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Pan3Q640Q5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pan3Q640Q5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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