Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt33bQ61897 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt33bQ61897 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt33bQ61897 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt33bQ61897 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt33bQ61897 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt33bQ61897 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt33bQ61897 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt33bQ61897 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt33bQ61897 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt33bQ61897 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt33bQ61897 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt33bQ61897 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt33bQ61897 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt33bQ61897 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt33bQ61897 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt33bQ61897 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt33bQ61897 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt33bQ61897 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt33bQ61897 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt33bQ61897 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt33bQ61897 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt33bQ61897 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt33bQ61897 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt33bQ61897 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt33bQ61897 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt33bQ61897 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt33bQ61897 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt33bQ61897 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt33bQ61897 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt33bQ61897 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt33bQ61897 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt33bQ61897 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt33bQ61897 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt33bQ61897 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt33bQ61897 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt33bQ61897 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt33bQ61897 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt33bQ61897 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt33bQ61897 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt33bQ61897 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt33bQ61897 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt33bQ61897 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt33bQ61897 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt33bQ61897 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt33bQ61897 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt33bQ61897 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt33bQ61897 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt33bQ61897 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt33bQ61897 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt33bQ61897 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt33bQ61897 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt33bQ61897 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt33bQ61897 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt33bQ61897 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt33bQ61897 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt33bQ61897 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt33bQ61897 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt33bQ61897 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt33bQ61897 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt33bQ61897 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt33bQ61897 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt33bQ61897 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt33bQ61897 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt33bQ61897 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt33bQ61897 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt33bQ61897 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt33bQ61897 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt33bQ61897 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt33bQ61897 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt33bQ61897 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt33bQ61897 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt33bQ61897 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt33bQ61897 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt33bQ61897 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt33bQ61897 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt33bQ61897 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt33bQ61897 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt33bQ61897 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt33bQ61897 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt33bQ61897 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt33bQ61897 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt33bQ61897 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt33bQ61897 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt33bQ61897 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt33bQ61897 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt33bQ61897 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt33bQ61897 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt33bQ61897 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt33bQ61897 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt33bQ61897 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt33bQ61897 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt33bQ61897 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt33bQ61897 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt33bQ61897 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms