Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CcnjQ3TZI6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CcnjQ3TZI6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CcnjQ3TZI6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CcnjQ3TZI6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CcnjQ3TZI6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CcnjQ3TZI6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CcnjQ3TZI6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CcnjQ3TZI6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CcnjQ3TZI6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CcnjQ3TZI6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CcnjQ3TZI6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CcnjQ3TZI6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CcnjQ3TZI6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CcnjQ3TZI6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CcnjQ3TZI6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CcnjQ3TZI6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CcnjQ3TZI6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CcnjQ3TZI6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CcnjQ3TZI6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CcnjQ3TZI6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CcnjQ3TZI6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CcnjQ3TZI6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CcnjQ3TZI6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CcnjQ3TZI6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CcnjQ3TZI6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CcnjQ3TZI6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CcnjQ3TZI6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CcnjQ3TZI6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CcnjQ3TZI6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CcnjQ3TZI6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CcnjQ3TZI6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnjQ3TZI6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CcnjQ3TZI6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CcnjQ3TZI6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcnjQ3TZI6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CcnjQ3TZI6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CcnjQ3TZI6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CcnjQ3TZI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CcnjQ3TZI6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CcnjQ3TZI6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CcnjQ3TZI6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CcnjQ3TZI6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcnjQ3TZI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CcnjQ3TZI6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CcnjQ3TZI6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CcnjQ3TZI6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CcnjQ3TZI6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CcnjQ3TZI6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CcnjQ3TZI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcnjQ3TZI6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcnjQ3TZI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CcnjQ3TZI6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CcnjQ3TZI6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CcnjQ3TZI6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CcnjQ3TZI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnjQ3TZI6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnjQ3TZI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CcnjQ3TZI6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CcnjQ3TZI6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnjQ3TZI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnjQ3TZI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnjQ3TZI6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CcnjQ3TZI6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnjQ3TZI6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjQ3TZI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjQ3TZI6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjQ3TZI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnjQ3TZI6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnjQ3TZI6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnjQ3TZI6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjQ3TZI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnjQ3TZI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjQ3TZI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnjQ3TZI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnjQ3TZI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcnjQ3TZI6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnjQ3TZI6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnjQ3TZI6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnjQ3TZI6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjQ3TZI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnjQ3TZI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnjQ3TZI6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CcnjQ3TZI6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcnjQ3TZI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnjQ3TZI6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcnjQ3TZI6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CcnjQ3TZI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CcnjQ3TZI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CcnjQ3TZI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcnjQ3TZI6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcnjQ3TZI6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnjQ3TZI6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnjQ3TZI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcnjQ3TZI6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CcnjQ3TZI6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcnjQ3TZI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnjQ3TZI6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnjQ3TZI6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnjQ3TZI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms