Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Mfsd2bQ3T9M1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mfsd2bQ3T9M1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mfsd2bQ3T9M1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mfsd2bQ3T9M1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mfsd2bQ3T9M1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mfsd2bQ3T9M1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mfsd2bQ3T9M1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mfsd2bQ3T9M1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Mfsd2bQ3T9M1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mfsd2bQ3T9M1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mfsd2bQ3T9M1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mfsd2bQ3T9M1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mfsd2bQ3T9M1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mfsd2bQ3T9M1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mfsd2bQ3T9M1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mfsd2bQ3T9M1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mfsd2bQ3T9M1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mfsd2bQ3T9M1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mfsd2bQ3T9M1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mfsd2bQ3T9M1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mfsd2bQ3T9M1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Mfsd2bQ3T9M1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mfsd2bQ3T9M1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mfsd2bQ3T9M1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mfsd2bQ3T9M1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mfsd2bQ3T9M1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Mfsd2bQ3T9M1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mfsd2bQ3T9M1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mfsd2bQ3T9M1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mfsd2bQ3T9M1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mfsd2bQ3T9M1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mfsd2bQ3T9M1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mfsd2bQ3T9M1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mfsd2bQ3T9M1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mfsd2bQ3T9M1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mfsd2bQ3T9M1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mfsd2bQ3T9M1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfsd2bQ3T9M1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mfsd2bQ3T9M1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mfsd2bQ3T9M1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mfsd2bQ3T9M1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mfsd2bQ3T9M1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mfsd2bQ3T9M1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mfsd2bQ3T9M1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mfsd2bQ3T9M1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfsd2bQ3T9M1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfsd2bQ3T9M1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfsd2bQ3T9M1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mfsd2bQ3T9M1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mfsd2bQ3T9M1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mfsd2bQ3T9M1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mfsd2bQ3T9M1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mfsd2bQ3T9M1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mfsd2bQ3T9M1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mfsd2bQ3T9M1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mfsd2bQ3T9M1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mfsd2bQ3T9M1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mfsd2bQ3T9M1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mfsd2bQ3T9M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mfsd2bQ3T9M1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mfsd2bQ3T9M1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mfsd2bQ3T9M1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mfsd2bQ3T9M1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mfsd2bQ3T9M1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mfsd2bQ3T9M1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mfsd2bQ3T9M1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mfsd2bQ3T9M1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mfsd2bQ3T9M1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfsd2bQ3T9M1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfsd2bQ3T9M1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfsd2bQ3T9M1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mfsd2bQ3T9M1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfsd2bQ3T9M1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mfsd2bQ3T9M1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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