Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 YEL076CYEL076C 651 nt15.29■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 YLR464WYLR464W 651 nt15.29■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 FUN26YAL022C 1554 nt15.27■□□□□ 0.03
HPC2Q01448 FPR4YLR449W 1179 nt15.25■□□□□ 0.03
HPC2Q01448 FIS1YIL065C 468 nt15.24■□□□□ 0.03
HPC2Q01448 CCT6YDR188W 1641 nt15.2■□□□□ 0.02
HPC2Q01448 PHO4YFR034C 939 nt15.17■□□□□ 0.02
HPC2Q01448 ERV46YAL042W 1248 nt15.15■□□□□ 0.02
HPC2Q01448 RTG1YOL067C 534 nt15.15■□□□□ 0.02
HPC2Q01448 LPX1YOR084W 1164 nt15.14■□□□□ 0.01
HPC2Q01448 SIS1YNL007C 1059 nt15.12■□□□□ 0.01
HPC2Q01448 SPP1YPL138C 1062 nt15.11■□□□□ 0.01
HPC2Q01448 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.02■□□□□ -0
HPC2Q01448 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.02■□□□□ -0
HPC2Q01448 IDH1YNL037C 1083 nt14.99□□□□□ -0.01
HPC2Q01448 YJL152WYJL152W 360 nt14.97□□□□□ -0.01
HPC2Q01448 YKR040CYKR040C 504 nt14.94□□□□□ -0.02
HPC2Q01448 YDR094WYDR094W 336 nt14.91□□□□□ -0.02
HPC2Q01448 YDR433WYDR433W 441 nt14.91□□□□□ -0.02
HPC2Q01448 ALF1YNL148C 765 nt14.89□□□□□ -0.03
HPC2Q01448 HUA1YGR268C 597 nt14.87□□□□□ -0.03
HPC2Q01448 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.85□□□□□ -0.03
HPC2Q01448 GBP2YCL011C 1284 nt14.75□□□□□ -0.05
HPC2Q01448 NME1NME1 340 nt14.7□□□□□ -0.06
HPC2Q01448 MXR2YCL033C 507 nt14.7□□□□□ -0.06
HPC2Q01448 YDR095CYDR095C 411 nt14.67□□□□□ -0.06
HPC2Q01448 TIR4YOR009W 1464 nt14.64□□□□□ -0.07
HPC2Q01448 YPS1YLR120C 1710 nt14.64□□□□□ -0.07
HPC2Q01448 CAC2YML102W 1407 nt14.52□□□□□ -0.08
HPC2Q01448 TCD2YKL027W 1344 nt14.49□□□□□ -0.09
HPC2Q01448 FRD1YEL047C 1413 nt14.44□□□□□ -0.1
HPC2Q01448 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.44□□□□□ -0.1
HPC2Q01448 SBA1YKL117W 651 nt14.42□□□□□ -0.1
HPC2Q01448 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.4□□□□□ -0.1
HPC2Q01448 RPP2AYOL039W 321 nt14.4□□□□□ -0.1
HPC2Q01448 YKL030WYKL030W 606 nt14.39□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 PET9YBL030C 957 nt14.38□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 YMR057CYMR057C 372 nt14.38□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 YGR139WYGR139W 339 nt14.36□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 ART5YGR068C 1761 nt14.35□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 PTH1YHR189W 573 nt14.34□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 YLR235CYLR235C 399 nt14.34□□□□□ -0.11
HPC2Q01448 DED1YOR204W 1815 nt14.32□□□□□ -0.12
HPC2Q01448 PAU16YKL224C 372 nt14.28□□□□□ -0.12
HPC2Q01448 RRD1YIL153W 1182 nt14.25□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 PTP1YDL230W 1008 nt14.24□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 LCB1YMR296C 1677 nt14.23□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 YCL042WYCL042W 360 nt14.23□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 GFD2YCL036W 1701 nt14.23□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 SOR2YDL246C 1074 nt14.21□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 YFR018CYFR018C 1092 nt14.21□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 SOR1YJR159W 1074 nt14.21□□□□□ -0.13
HPC2Q01448 RRT5YFR032C 870 nt14.18□□□□□ -0.14
HPC2Q01448 FMT1YBL013W 1206 nt14.12□□□□□ -0.15
HPC2Q01448 FPS1YLL043W 2010 nt14.1□□□□□ -0.15
HPC2Q01448 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.09□□□□□ -0.15
HPC2Q01448 PRE6YOL038W 765 nt14.06□□□□□ -0.16
HPC2Q01448 MEP2YNL142W 1500 nt14□□□□□ -0.17
HPC2Q01448 FMP52YER004W 696 nt13.97□□□□□ -0.17
HPC2Q01448 TIM23YNR017W 669 nt13.97□□□□□ -0.17
HPC2Q01448 SNF6YHL025W 999 nt13.95□□□□□ -0.18
HPC2Q01448 DIC1YLR348C 897 nt13.92□□□□□ -0.18
HPC2Q01448 RTS2YOR077W 699 nt13.92□□□□□ -0.18
HPC2Q01448 CWP1YKL096W 720 nt13.89□□□□□ -0.19
HPC2Q01448 YPR064WYPR064W 420 nt13.86□□□□□ -0.19
HPC2Q01448 CUE1YMR264W 612 nt13.85□□□□□ -0.19
HPC2Q01448 ADH2YMR303C 1047 nt13.84□□□□□ -0.19
HPC2Q01448 YLR179CYLR179C 606 nt13.83□□□□□ -0.2
HPC2Q01448 TAD3YLR316C 969 nt13.81□□□□□ -0.2
HPC2Q01448 NAT4YMR069W 858 nt13.79□□□□□ -0.2
HPC2Q01448 DCW1YKL046C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
HPC2Q01448 SPT5YML010W 3192 nt13.77□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 IRC15YPL017C 1500 nt13.77□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 YFL066CYFL066C 1179 nt13.73□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 PEX25YPL112C 1185 nt13.73□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 AHT1YHR093W 549 nt13.72□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 WSC2YNL283C 1512 nt13.72□□□□□ -0.21
HPC2Q01448 RNQ1YCL028W 1218 nt13.67□□□□□ -0.22
HPC2Q01448 EMI2YDR516C 1503 nt13.67□□□□□ -0.22
HPC2Q01448 YIL100WYIL100W 354 nt13.66□□□□□ -0.22
HPC2Q01448 YDL221WYDL221W 552 nt13.65□□□□□ -0.22
HPC2Q01448 GLK1YCL040W 1503 nt13.64□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 PCM1YEL058W 1674 nt13.64□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 GIS3YLR094C 1509 nt13.63□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 YIH1YCR059C 777 nt13.61□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 MSF1YPR047W 1410 nt13.61□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 YMR244WYMR244W 1068 nt13.6□□□□□ -0.23
HPC2Q01448 YSP3YOR003W 1437 nt13.58□□□□□ -0.24
HPC2Q01448 YNL115CYNL115C 1935 nt13.54□□□□□ -0.24
HPC2Q01448 BDH1YAL060W 1149 nt13.54□□□□□ -0.24
HPC2Q01448 YMR090WYMR090W 684 nt13.53□□□□□ -0.24
HPC2Q01448 THI74YDR438W 1113 nt13.51□□□□□ -0.25
HPC2Q01448 MIR1YJR077C 936 nt13.5□□□□□ -0.25
HPC2Q01448 AQY1YPR192W 918 nt13.5□□□□□ -0.25
HPC2Q01448 SSA4YER103W 1929 nt13.5□□□□□ -0.25
HPC2Q01448 YLR415CYLR415C 339 nt13.47□□□□□ -0.25
HPC2Q01448 YSC84YHR016C 1407 nt13.43□□□□□ -0.26
HPC2Q01448 GLR1YPL091W 1452 nt13.42□□□□□ -0.26
HPC2Q01448 YLL053CYLL053C 459 nt13.4□□□□□ -0.26
HPC2Q01448 CSM2YIL132C 642 nt13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms