Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gabra1P62812 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gabra1P62812 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gabra1P62812 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabra1P62812 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabra1P62812 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabra1P62812 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gabra1P62812 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gabra1P62812 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabra1P62812 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabra1P62812 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabra1P62812 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabra1P62812 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabra1P62812 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabra1P62812 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabra1P62812 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabra1P62812 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabra1P62812 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabra1P62812 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabra1P62812 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabra1P62812 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabra1P62812 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabra1P62812 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabra1P62812 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabra1P62812 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabra1P62812 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gabra1P62812 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabra1P62812 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabra1P62812 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabra1P62812 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabra1P62812 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra1P62812 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabra1P62812 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra1P62812 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabra1P62812 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra1P62812 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra1P62812 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabra1P62812 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra1P62812 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra1P62812 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabra1P62812 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabra1P62812 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabra1P62812 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabra1P62812 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabra1P62812 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabra1P62812 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra1P62812 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra1P62812 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabra1P62812 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabra1P62812 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabra1P62812 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabra1P62812 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabra1P62812 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabra1P62812 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gabra1P62812 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabra1P62812 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabra1P62812 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabra1P62812 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabra1P62812 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabra1P62812 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra1P62812 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra1P62812 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabra1P62812 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabra1P62812 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabra1P62812 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabra1P62812 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra1P62812 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra1P62812 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra1P62812 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra1P62812 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra1P62812 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra1P62812 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra1P62812 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra1P62812 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra1P62812 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra1P62812 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra1P62812 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra1P62812 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra1P62812 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra1P62812 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra1P62812 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabra1P62812 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabra1P62812 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra1P62812 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabra1P62812 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabra1P62812 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabra1P62812 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabra1P62812 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabra1P62812 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabra1P62812 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabra1P62812 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabra1P62812 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabra1P62812 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabra1P62812 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabra1P62812 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms