Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tspan5P62080 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tspan5P62080 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tspan5P62080 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tspan5P62080 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tspan5P62080 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tspan5P62080 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tspan5P62080 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tspan5P62080 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tspan5P62080 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tspan5P62080 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tspan5P62080 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tspan5P62080 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tspan5P62080 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tspan5P62080 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tspan5P62080 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tspan5P62080 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan5P62080 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tspan5P62080 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tspan5P62080 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan5P62080 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tspan5P62080 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan5P62080 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tspan5P62080 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tspan5P62080 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan5P62080 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan5P62080 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan5P62080 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan5P62080 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan5P62080 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan5P62080 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan5P62080 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tspan5P62080 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan5P62080 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tspan5P62080 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan5P62080 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan5P62080 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tspan5P62080 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan5P62080 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan5P62080 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan5P62080 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan5P62080 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan5P62080 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan5P62080 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan5P62080 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan5P62080 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan5P62080 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan5P62080 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan5P62080 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan5P62080 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan5P62080 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan5P62080 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan5P62080 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan5P62080 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan5P62080 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan5P62080 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan5P62080 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan5P62080 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan5P62080 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan5P62080 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan5P62080 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan5P62080 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan5P62080 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan5P62080 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan5P62080 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan5P62080 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan5P62080 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan5P62080 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan5P62080 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan5P62080 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan5P62080 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan5P62080 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan5P62080 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan5P62080 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan5P62080 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan5P62080 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan5P62080 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan5P62080 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan5P62080 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan5P62080 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan5P62080 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms