Protein–RNA interactions for Protein: P60521

Gabarapl2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabarapl2P60521 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gabarapl2P60521 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gabarapl2P60521 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gabarapl2P60521 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gabarapl2P60521 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gabarapl2P60521 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gabarapl2P60521 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gabarapl2P60521 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gabarapl2P60521 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gabarapl2P60521 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gabarapl2P60521 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gabarapl2P60521 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gabarapl2P60521 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gabarapl2P60521 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gabarapl2P60521 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gabarapl2P60521 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gabarapl2P60521 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gabarapl2P60521 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gabarapl2P60521 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gabarapl2P60521 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabarapl2P60521 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gabarapl2P60521 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gabarapl2P60521 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabarapl2P60521 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gabarapl2P60521 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabarapl2P60521 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gabarapl2P60521 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabarapl2P60521 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gabarapl2P60521 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gabarapl2P60521 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabarapl2P60521 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gabarapl2P60521 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gabarapl2P60521 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gabarapl2P60521 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabarapl2P60521 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gabarapl2P60521 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabarapl2P60521 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gabarapl2P60521 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabarapl2P60521 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gabarapl2P60521 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabarapl2P60521 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabarapl2P60521 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabarapl2P60521 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gabarapl2P60521 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabarapl2P60521 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabarapl2P60521 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabarapl2P60521 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gabarapl2P60521 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gabarapl2P60521 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabarapl2P60521 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabarapl2P60521 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabarapl2P60521 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabarapl2P60521 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabarapl2P60521 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gabarapl2P60521 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabarapl2P60521 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gabarapl2P60521 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabarapl2P60521 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabarapl2P60521 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabarapl2P60521 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabarapl2P60521 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabarapl2P60521 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabarapl2P60521 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabarapl2P60521 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabarapl2P60521 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabarapl2P60521 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabarapl2P60521 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabarapl2P60521 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabarapl2P60521 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabarapl2P60521 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gabarapl2P60521 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabarapl2P60521 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabarapl2P60521 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabarapl2P60521 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabarapl2P60521 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabarapl2P60521 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabarapl2P60521 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabarapl2P60521 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabarapl2P60521 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabarapl2P60521 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabarapl2P60521 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gabarapl2P60521 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabarapl2P60521 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabarapl2P60521 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabarapl2P60521 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabarapl2P60521 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabarapl2P60521 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabarapl2P60521 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabarapl2P60521 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabarapl2P60521 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms