Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab5cP35278 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab5cP35278 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rab5cP35278 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab5cP35278 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab5cP35278 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rab5cP35278 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab5cP35278 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab5cP35278 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab5cP35278 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab5cP35278 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab5cP35278 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab5cP35278 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab5cP35278 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab5cP35278 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab5cP35278 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab5cP35278 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab5cP35278 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab5cP35278 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab5cP35278 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab5cP35278 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab5cP35278 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab5cP35278 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab5cP35278 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab5cP35278 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab5cP35278 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab5cP35278 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab5cP35278 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab5cP35278 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab5cP35278 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab5cP35278 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab5cP35278 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab5cP35278 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab5cP35278 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab5cP35278 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab5cP35278 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab5cP35278 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab5cP35278 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab5cP35278 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab5cP35278 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab5cP35278 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab5cP35278 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab5cP35278 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab5cP35278 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab5cP35278 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab5cP35278 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab5cP35278 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab5cP35278 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab5cP35278 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab5cP35278 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab5cP35278 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab5cP35278 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab5cP35278 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab5cP35278 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab5cP35278 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab5cP35278 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab5cP35278 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab5cP35278 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab5cP35278 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab5cP35278 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab5cP35278 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab5cP35278 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab5cP35278 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab5cP35278 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab5cP35278 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab5cP35278 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab5cP35278 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab5cP35278 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab5cP35278 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab5cP35278 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab5cP35278 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab5cP35278 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab5cP35278 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab5cP35278 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab5cP35278 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab5cP35278 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab5cP35278 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab5cP35278 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab5cP35278 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab5cP35278 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab5cP35278 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab5cP35278 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab5cP35278 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab5cP35278 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab5cP35278 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab5cP35278 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab5cP35278 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab5cP35278 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab5cP35278 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab5cP35278 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab5cP35278 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab5cP35278 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab5cP35278 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms