Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccnd1P25322 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccnd1P25322 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccnd1P25322 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccnd1P25322 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccnd1P25322 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccnd1P25322 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccnd1P25322 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccnd1P25322 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccnd1P25322 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnd1P25322 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccnd1P25322 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccnd1P25322 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccnd1P25322 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccnd1P25322 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccnd1P25322 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccnd1P25322 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccnd1P25322 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccnd1P25322 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccnd1P25322 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccnd1P25322 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccnd1P25322 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnd1P25322 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnd1P25322 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnd1P25322 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccnd1P25322 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnd1P25322 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccnd1P25322 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccnd1P25322 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccnd1P25322 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccnd1P25322 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnd1P25322 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccnd1P25322 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccnd1P25322 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccnd1P25322 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccnd1P25322 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccnd1P25322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccnd1P25322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccnd1P25322 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccnd1P25322 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccnd1P25322 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccnd1P25322 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccnd1P25322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccnd1P25322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccnd1P25322 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccnd1P25322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccnd1P25322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccnd1P25322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccnd1P25322 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccnd1P25322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccnd1P25322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnd1P25322 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccnd1P25322 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccnd1P25322 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccnd1P25322 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccnd1P25322 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnd1P25322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccnd1P25322 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccnd1P25322 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnd1P25322 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnd1P25322 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccnd1P25322 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnd1P25322 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnd1P25322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnd1P25322 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnd1P25322 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnd1P25322 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnd1P25322 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnd1P25322 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnd1P25322 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnd1P25322 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd1P25322 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnd1P25322 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnd1P25322 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnd1P25322 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnd1P25322 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnd1P25322 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnd1P25322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnd1P25322 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd1P25322 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd1P25322 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd1P25322 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnd1P25322 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnd1P25322 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnd1P25322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnd1P25322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnd1P25322 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd1P25322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccnd1P25322 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccnd1P25322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccnd1P25322 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccnd1P25322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccnd1P25322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccnd1P25322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms