Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ntf3P20181 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ntf3P20181 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ntf3P20181 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ntf3P20181 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ntf3P20181 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ntf3P20181 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ntf3P20181 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ntf3P20181 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ntf3P20181 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ntf3P20181 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ntf3P20181 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ntf3P20181 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ntf3P20181 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ntf3P20181 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ntf3P20181 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ntf3P20181 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ntf3P20181 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ntf3P20181 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ntf3P20181 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ntf3P20181 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ntf3P20181 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ntf3P20181 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ntf3P20181 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ntf3P20181 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ntf3P20181 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ntf3P20181 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ntf3P20181 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ntf3P20181 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ntf3P20181 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ntf3P20181 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ntf3P20181 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ntf3P20181 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ntf3P20181 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ntf3P20181 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ntf3P20181 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ntf3P20181 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ntf3P20181 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ntf3P20181 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ntf3P20181 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ntf3P20181 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ntf3P20181 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ntf3P20181 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ntf3P20181 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ntf3P20181 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ntf3P20181 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ntf3P20181 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ntf3P20181 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ntf3P20181 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ntf3P20181 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ntf3P20181 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ntf3P20181 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ntf3P20181 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ntf3P20181 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ntf3P20181 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ntf3P20181 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ntf3P20181 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ntf3P20181 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ntf3P20181 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ntf3P20181 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ntf3P20181 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ntf3P20181 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ntf3P20181 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ntf3P20181 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ntf3P20181 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ntf3P20181 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ntf3P20181 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ntf3P20181 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ntf3P20181 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ntf3P20181 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ntf3P20181 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ntf3P20181 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ntf3P20181 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ntf3P20181 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ntf3P20181 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ntf3P20181 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ntf3P20181 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ntf3P20181 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ntf3P20181 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ntf3P20181 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ntf3P20181 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ntf3P20181 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ntf3P20181 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ntf3P20181 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ntf3P20181 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ntf3P20181 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ntf3P20181 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ntf3P20181 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ntf3P20181 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ntf3P20181 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ntf3P20181 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ntf3P20181 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ntf3P20181 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ntf3P20181 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ntf3P20181 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms