Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxd4P10628 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxd4P10628 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxd4P10628 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxd4P10628 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxd4P10628 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxd4P10628 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxd4P10628 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd4P10628 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxd4P10628 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4P10628 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd4P10628 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd4P10628 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd4P10628 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd4P10628 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd4P10628 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd4P10628 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd4P10628 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd4P10628 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxd4P10628 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxd4P10628 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxd4P10628 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxd4P10628 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxd4P10628 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxd4P10628 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd4P10628 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxd4P10628 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxd4P10628 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxd4P10628 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxd4P10628 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxd4P10628 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxd4P10628 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd4P10628 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxd4P10628 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd4P10628 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd4P10628 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd4P10628 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4P10628 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd4P10628 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd4P10628 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd4P10628 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd4P10628 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxd4P10628 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd4P10628 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd4P10628 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd4P10628 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd4P10628 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd4P10628 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd4P10628 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxd4P10628 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd4P10628 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxd4P10628 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd4P10628 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd4P10628 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd4P10628 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd4P10628 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd4P10628 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd4P10628 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd4P10628 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd4P10628 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd4P10628 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd4P10628 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd4P10628 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd4P10628 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd4P10628 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd4P10628 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd4P10628 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd4P10628 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd4P10628 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd4P10628 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd4P10628 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd4P10628 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd4P10628 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd4P10628 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd4P10628 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd4P10628 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd4P10628 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4P10628 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd4P10628 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd4P10628 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4P10628 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd4P10628 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd4P10628 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd4P10628 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd4P10628 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd4P10628 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd4P10628 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms