Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcrg-V1P06325 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcrg-V1P06325 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcrg-V1P06325 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcrg-V1P06325 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcrg-V1P06325 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcrg-V1P06325 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcrg-V1P06325 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tcrg-V1P06325 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcrg-V1P06325 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcrg-V1P06325 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcrg-V1P06325 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tcrg-V1P06325 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcrg-V1P06325 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcrg-V1P06325 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcrg-V1P06325 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcrg-V1P06325 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcrg-V1P06325 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcrg-V1P06325 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcrg-V1P06325 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcrg-V1P06325 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcrg-V1P06325 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcrg-V1P06325 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcrg-V1P06325 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcrg-V1P06325 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcrg-V1P06325 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcrg-V1P06325 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcrg-V1P06325 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcrg-V1P06325 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcrg-V1P06325 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcrg-V1P06325 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcrg-V1P06325 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcrg-V1P06325 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcrg-V1P06325 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcrg-V1P06325 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcrg-V1P06325 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcrg-V1P06325 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcrg-V1P06325 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcrg-V1P06325 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcrg-V1P06325 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcrg-V1P06325 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcrg-V1P06325 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcrg-V1P06325 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcrg-V1P06325 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcrg-V1P06325 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcrg-V1P06325 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcrg-V1P06325 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcrg-V1P06325 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcrg-V1P06325 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcrg-V1P06325 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcrg-V1P06325 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcrg-V1P06325 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcrg-V1P06325 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcrg-V1P06325 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcrg-V1P06325 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcrg-V1P06325 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcrg-V1P06325 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcrg-V1P06325 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcrg-V1P06325 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcrg-V1P06325 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcrg-V1P06325 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tcrg-V1P06325 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcrg-V1P06325 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcrg-V1P06325 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcrg-V1P06325 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcrg-V1P06325 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcrg-V1P06325 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcrg-V1P06325 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcrg-V1P06325 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcrg-V1P06325 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcrg-V1P06325 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcrg-V1P06325 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcrg-V1P06325 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcrg-V1P06325 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcrg-V1P06325 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcrg-V1P06325 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcrg-V1P06325 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcrg-V1P06325 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcrg-V1P06325 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcrg-V1P06325 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcrg-V1P06325 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcrg-V1P06325 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcrg-V1P06325 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcrg-V1P06325 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcrg-V1P06325 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcrg-V1P06325 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcrg-V1P06325 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcrg-V1P06325 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcrg-V1P06325 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcrg-V1P06325 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcrg-V1P06325 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcrg-V1P06325 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcrg-V1P06325 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcrg-V1P06325 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcrg-V1P06325 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms