Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hbb-bh1P04444 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hbb-bh1P04444 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hbb-bh1P04444 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hbb-bh1P04444 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hbb-bh1P04444 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hbb-bh1P04444 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hbb-bh1P04444 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hbb-bh1P04444 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hbb-bh1P04444 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hbb-bh1P04444 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hbb-bh1P04444 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hbb-bh1P04444 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hbb-bh1P04444 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hbb-bh1P04444 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hbb-bh1P04444 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hbb-bh1P04444 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hbb-bh1P04444 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hbb-bh1P04444 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hbb-bh1P04444 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hbb-bh1P04444 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hbb-bh1P04444 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hbb-bh1P04444 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hbb-bh1P04444 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hbb-bh1P04444 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hbb-bh1P04444 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hbb-bh1P04444 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hbb-bh1P04444 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hbb-bh1P04444 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hbb-bh1P04444 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hbb-bh1P04444 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hbb-bh1P04444 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hbb-bh1P04444 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hbb-bh1P04444 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hbb-bh1P04444 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hbb-bh1P04444 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hbb-bh1P04444 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hbb-bh1P04444 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hbb-bh1P04444 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hbb-bh1P04444 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hbb-bh1P04444 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hbb-bh1P04444 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hbb-bh1P04444 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hbb-bh1P04444 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hbb-bh1P04444 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hbb-bh1P04444 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hbb-bh1P04444 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hbb-bh1P04444 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hbb-bh1P04444 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hbb-bh1P04444 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hbb-bh1P04444 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hbb-bh1P04444 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hbb-bh1P04444 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hbb-bh1P04444 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hbb-bh1P04444 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hbb-bh1P04444 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hbb-bh1P04444 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hbb-bh1P04444 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hbb-bh1P04444 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hbb-bh1P04444 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hbb-bh1P04444 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hbb-bh1P04444 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hbb-bh1P04444 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hbb-bh1P04444 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hbb-bh1P04444 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hbb-bh1P04444 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hbb-bh1P04444 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hbb-bh1P04444 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hbb-bh1P04444 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hbb-bh1P04444 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hbb-bh1P04444 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hbb-bh1P04444 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hbb-bh1P04444 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hbb-bh1P04444 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hbb-bh1P04444 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hbb-bh1P04444 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hbb-bh1P04444 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hbb-bh1P04444 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbb-bh1P04444 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hbb-bh1P04444 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbb-bh1P04444 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hbb-bh1P04444 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbb-bh1P04444 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hbb-bh1P04444 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hbb-bh1P04444 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hbb-bh1P04444 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hbb-bh1P04444 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hbb-bh1P04444 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hbb-bh1P04444 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbb-bh1P04444 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbb-bh1P04444 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hbb-bh1P04444 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hbb-bh1P04444 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hbb-bh1P04444 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hbb-bh1P04444 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms