Protein–RNA interactions for Protein: O88495

Gpr50, Melatonin-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr50O88495 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gpr50O88495 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gpr50O88495 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gpr50O88495 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gpr50O88495 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Gpr50O88495 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gpr50O88495 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpr50O88495 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gpr50O88495 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gpr50O88495 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gpr50O88495 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpr50O88495 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpr50O88495 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpr50O88495 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpr50O88495 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpr50O88495 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpr50O88495 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpr50O88495 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpr50O88495 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gpr50O88495 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpr50O88495 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpr50O88495 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpr50O88495 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpr50O88495 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpr50O88495 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpr50O88495 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpr50O88495 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpr50O88495 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpr50O88495 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpr50O88495 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpr50O88495 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpr50O88495 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpr50O88495 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpr50O88495 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpr50O88495 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpr50O88495 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpr50O88495 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpr50O88495 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpr50O88495 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gpr50O88495 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gpr50O88495 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gpr50O88495 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gpr50O88495 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpr50O88495 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpr50O88495 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gpr50O88495 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gpr50O88495 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpr50O88495 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpr50O88495 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpr50O88495 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpr50O88495 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpr50O88495 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpr50O88495 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpr50O88495 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpr50O88495 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpr50O88495 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpr50O88495 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpr50O88495 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpr50O88495 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpr50O88495 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpr50O88495 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpr50O88495 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gpr50O88495 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpr50O88495 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpr50O88495 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpr50O88495 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpr50O88495 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpr50O88495 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpr50O88495 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpr50O88495 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpr50O88495 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpr50O88495 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpr50O88495 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr50O88495 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpr50O88495 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpr50O88495 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpr50O88495 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpr50O88495 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpr50O88495 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpr50O88495 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpr50O88495 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gpr50O88495 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpr50O88495 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpr50O88495 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpr50O88495 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpr50O88495 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr50O88495 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpr50O88495 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpr50O88495 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpr50O88495 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpr50O88495 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpr50O88495 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpr50O88495 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpr50O88495 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpr50O88495 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpr50O88495 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpr50O88495 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpr50O88495 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpr50O88495 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpr50O88495 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.6 ms