Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Snx3O70492 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Snx3O70492 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Snx3O70492 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Snx3O70492 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Snx3O70492 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Snx3O70492 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Snx3O70492 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Snx3O70492 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Snx3O70492 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Snx3O70492 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Snx3O70492 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Snx3O70492 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Snx3O70492 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Snx3O70492 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Snx3O70492 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Snx3O70492 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Snx3O70492 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Snx3O70492 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Snx3O70492 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snx3O70492 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx3O70492 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snx3O70492 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snx3O70492 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snx3O70492 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx3O70492 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx3O70492 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Snx3O70492 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snx3O70492 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snx3O70492 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snx3O70492 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snx3O70492 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snx3O70492 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Snx3O70492 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx3O70492 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx3O70492 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snx3O70492 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snx3O70492 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Snx3O70492 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx3O70492 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx3O70492 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snx3O70492 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx3O70492 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snx3O70492 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx3O70492 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx3O70492 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx3O70492 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx3O70492 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx3O70492 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx3O70492 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx3O70492 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx3O70492 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx3O70492 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx3O70492 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx3O70492 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx3O70492 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx3O70492 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx3O70492 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx3O70492 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx3O70492 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx3O70492 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx3O70492 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx3O70492 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Snx3O70492 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx3O70492 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx3O70492 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx3O70492 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx3O70492 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx3O70492 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snx3O70492 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Snx3O70492 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx3O70492 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx3O70492 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx3O70492 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx3O70492 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Snx3O70492 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Snx3O70492 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx3O70492 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx3O70492 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx3O70492 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx3O70492 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx3O70492 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx3O70492 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx3O70492 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx3O70492 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snx3O70492 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Snx3O70492 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx3O70492 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx3O70492 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx3O70492 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx3O70492 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx3O70492 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx3O70492 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx3O70492 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx3O70492 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx3O70492 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx3O70492 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx3O70492 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx3O70492 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx3O70492 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms