Protein–RNA interactions for Protein: O35103

Omd, Osteomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OmdO35103 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
OmdO35103 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
OmdO35103 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
OmdO35103 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
OmdO35103 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
OmdO35103 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
OmdO35103 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
OmdO35103 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
OmdO35103 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
OmdO35103 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OmdO35103 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OmdO35103 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OmdO35103 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OmdO35103 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OmdO35103 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OmdO35103 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OmdO35103 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
OmdO35103 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OmdO35103 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
OmdO35103 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OmdO35103 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OmdO35103 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
OmdO35103 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OmdO35103 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OmdO35103 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
OmdO35103 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OmdO35103 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OmdO35103 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OmdO35103 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OmdO35103 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OmdO35103 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OmdO35103 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OmdO35103 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OmdO35103 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OmdO35103 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OmdO35103 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OmdO35103 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OmdO35103 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OmdO35103 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OmdO35103 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OmdO35103 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OmdO35103 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OmdO35103 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OmdO35103 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OmdO35103 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OmdO35103 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
OmdO35103 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OmdO35103 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OmdO35103 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OmdO35103 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
OmdO35103 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OmdO35103 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OmdO35103 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
OmdO35103 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OmdO35103 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OmdO35103 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OmdO35103 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OmdO35103 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OmdO35103 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OmdO35103 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OmdO35103 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OmdO35103 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OmdO35103 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OmdO35103 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OmdO35103 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OmdO35103 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OmdO35103 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OmdO35103 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
OmdO35103 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OmdO35103 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OmdO35103 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OmdO35103 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OmdO35103 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OmdO35103 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OmdO35103 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OmdO35103 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OmdO35103 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OmdO35103 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
OmdO35103 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OmdO35103 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OmdO35103 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OmdO35103 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OmdO35103 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OmdO35103 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OmdO35103 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
OmdO35103 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OmdO35103 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OmdO35103 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OmdO35103 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OmdO35103 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OmdO35103 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OmdO35103 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OmdO35103 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OmdO35103 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OmdO35103 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OmdO35103 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OmdO35103 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OmdO35103 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OmdO35103 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OmdO35103 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms