Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G9

Gm8677, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8677K9J7G9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm8677K9J7G9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm8677K9J7G9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm8677K9J7G9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm8677K9J7G9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm8677K9J7G9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Gm8677K9J7G9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm8677K9J7G9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm8677K9J7G9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8677K9J7G9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8677K9J7G9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8677K9J7G9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8677K9J7G9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8677K9J7G9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8677K9J7G9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm8677K9J7G9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8677K9J7G9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm8677K9J7G9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8677K9J7G9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8677K9J7G9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8677K9J7G9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8677K9J7G9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8677K9J7G9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8677K9J7G9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm8677K9J7G9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm8677K9J7G9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm8677K9J7G9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm8677K9J7G9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8677K9J7G9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8677K9J7G9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8677K9J7G9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8677K9J7G9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8677K9J7G9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8677K9J7G9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8677K9J7G9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8677K9J7G9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8677K9J7G9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8677K9J7G9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8677K9J7G9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8677K9J7G9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8677K9J7G9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8677K9J7G9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8677K9J7G9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8677K9J7G9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8677K9J7G9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8677K9J7G9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8677K9J7G9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8677K9J7G9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8677K9J7G9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8677K9J7G9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8677K9J7G9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8677K9J7G9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8677K9J7G9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8677K9J7G9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8677K9J7G9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8677K9J7G9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8677K9J7G9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8677K9J7G9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8677K9J7G9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8677K9J7G9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8677K9J7G9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8677K9J7G9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8677K9J7G9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8677K9J7G9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8677K9J7G9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8677K9J7G9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8677K9J7G9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8677K9J7G9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8677K9J7G9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8677K9J7G9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8677K9J7G9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8677K9J7G9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8677K9J7G9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8677K9J7G9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8677K9J7G9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8677K9J7G9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8677K9J7G9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8677K9J7G9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8677K9J7G9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8677K9J7G9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8677K9J7G9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8677K9J7G9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8677K9J7G9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8677K9J7G9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8677K9J7G9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8677K9J7G9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8677K9J7G9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8677K9J7G9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8677K9J7G9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8677K9J7G9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8677K9J7G9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8677K9J7G9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8677K9J7G9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8677K9J7G9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8677K9J7G9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8677K9J7G9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8677K9J7G9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8677K9J7G9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8677K9J7G9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8677K9J7G9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms