Protein–RNA interactions for Protein: G3XA50

Lrrc10b, Leucine-rich repeat-containing 10B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc10bG3XA50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrrc10bG3XA50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lrrc10bG3XA50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc10bG3XA50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc10bG3XA50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lrrc10bG3XA50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrrc10bG3XA50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc10bG3XA50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrrc10bG3XA50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc10bG3XA50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lrrc10bG3XA50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrrc10bG3XA50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrrc10bG3XA50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lrrc10bG3XA50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lrrc10bG3XA50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc10bG3XA50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lrrc10bG3XA50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lrrc10bG3XA50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lrrc10bG3XA50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Lrrc10bG3XA50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrc10bG3XA50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc10bG3XA50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc10bG3XA50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc10bG3XA50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc10bG3XA50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc10bG3XA50 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc10bG3XA50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc10bG3XA50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc10bG3XA50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc10bG3XA50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc10bG3XA50 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc10bG3XA50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc10bG3XA50 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc10bG3XA50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc10bG3XA50 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc10bG3XA50 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc10bG3XA50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc10bG3XA50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc10bG3XA50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc10bG3XA50 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc10bG3XA50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc10bG3XA50 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc10bG3XA50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc10bG3XA50 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc10bG3XA50 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc10bG3XA50 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc10bG3XA50 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc10bG3XA50 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc10bG3XA50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc10bG3XA50 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc10bG3XA50 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc10bG3XA50 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc10bG3XA50 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc10bG3XA50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc10bG3XA50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc10bG3XA50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc10bG3XA50 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc10bG3XA50 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc10bG3XA50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc10bG3XA50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc10bG3XA50 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc10bG3XA50 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc10bG3XA50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc10bG3XA50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc10bG3XA50 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc10bG3XA50 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc10bG3XA50 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc10bG3XA50 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc10bG3XA50 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lrrc10bG3XA50 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc10bG3XA50 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc10bG3XA50 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc10bG3XA50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc10bG3XA50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc10bG3XA50 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc10bG3XA50 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc10bG3XA50 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc10bG3XA50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc10bG3XA50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc10bG3XA50 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc10bG3XA50 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc10bG3XA50 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrrc10bG3XA50 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrc10bG3XA50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrc10bG3XA50 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrc10bG3XA50 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc10bG3XA50 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc10bG3XA50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc10bG3XA50 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc10bG3XA50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc10bG3XA50 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc10bG3XA50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc10bG3XA50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc10bG3XA50 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc10bG3XA50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc10bG3XA50 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc10bG3XA50 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc10bG3XA50 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc10bG3XA50 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc10bG3XA50 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms