Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trim15G3UY57 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trim15G3UY57 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim15G3UY57 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim15G3UY57 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim15G3UY57 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim15G3UY57 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim15G3UY57 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim15G3UY57 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim15G3UY57 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim15G3UY57 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim15G3UY57 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim15G3UY57 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim15G3UY57 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim15G3UY57 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim15G3UY57 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim15G3UY57 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim15G3UY57 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim15G3UY57 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim15G3UY57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim15G3UY57 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim15G3UY57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim15G3UY57 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim15G3UY57 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim15G3UY57 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim15G3UY57 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim15G3UY57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim15G3UY57 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim15G3UY57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim15G3UY57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim15G3UY57 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim15G3UY57 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim15G3UY57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim15G3UY57 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim15G3UY57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim15G3UY57 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim15G3UY57 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim15G3UY57 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim15G3UY57 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim15G3UY57 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim15G3UY57 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim15G3UY57 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim15G3UY57 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim15G3UY57 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim15G3UY57 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim15G3UY57 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim15G3UY57 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim15G3UY57 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim15G3UY57 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim15G3UY57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim15G3UY57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim15G3UY57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim15G3UY57 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim15G3UY57 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim15G3UY57 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim15G3UY57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim15G3UY57 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim15G3UY57 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim15G3UY57 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim15G3UY57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim15G3UY57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim15G3UY57 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim15G3UY57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim15G3UY57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim15G3UY57 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim15G3UY57 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim15G3UY57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim15G3UY57 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim15G3UY57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim15G3UY57 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim15G3UY57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim15G3UY57 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim15G3UY57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim15G3UY57 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim15G3UY57 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim15G3UY57 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim15G3UY57 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim15G3UY57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim15G3UY57 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim15G3UY57 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim15G3UY57 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim15G3UY57 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim15G3UY57 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim15G3UY57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim15G3UY57 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim15G3UY57 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim15G3UY57 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim15G3UY57 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim15G3UY57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim15G3UY57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim15G3UY57 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim15G3UY57 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim15G3UY57 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim15G3UY57 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim15G3UY57 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim15G3UY57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim15G3UY57 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms