Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D5

Rabl2, Rab-like protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl2E9Q9D5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabl2E9Q9D5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rabl2E9Q9D5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rabl2E9Q9D5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rabl2E9Q9D5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rabl2E9Q9D5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rabl2E9Q9D5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rabl2E9Q9D5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rabl2E9Q9D5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabl2E9Q9D5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabl2E9Q9D5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabl2E9Q9D5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rabl2E9Q9D5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabl2E9Q9D5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabl2E9Q9D5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rabl2E9Q9D5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rabl2E9Q9D5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rabl2E9Q9D5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabl2E9Q9D5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabl2E9Q9D5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabl2E9Q9D5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabl2E9Q9D5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabl2E9Q9D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl2E9Q9D5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabl2E9Q9D5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabl2E9Q9D5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabl2E9Q9D5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl2E9Q9D5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rabl2E9Q9D5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabl2E9Q9D5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabl2E9Q9D5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabl2E9Q9D5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabl2E9Q9D5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabl2E9Q9D5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabl2E9Q9D5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rabl2E9Q9D5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabl2E9Q9D5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl2E9Q9D5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl2E9Q9D5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabl2E9Q9D5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabl2E9Q9D5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabl2E9Q9D5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabl2E9Q9D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl2E9Q9D5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl2E9Q9D5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl2E9Q9D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabl2E9Q9D5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rabl2E9Q9D5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabl2E9Q9D5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabl2E9Q9D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl2E9Q9D5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabl2E9Q9D5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabl2E9Q9D5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabl2E9Q9D5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabl2E9Q9D5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabl2E9Q9D5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl2E9Q9D5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl2E9Q9D5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl2E9Q9D5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl2E9Q9D5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl2E9Q9D5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl2E9Q9D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl2E9Q9D5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl2E9Q9D5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabl2E9Q9D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl2E9Q9D5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl2E9Q9D5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl2E9Q9D5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl2E9Q9D5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl2E9Q9D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl2E9Q9D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rabl2E9Q9D5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabl2E9Q9D5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabl2E9Q9D5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabl2E9Q9D5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabl2E9Q9D5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl2E9Q9D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl2E9Q9D5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl2E9Q9D5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl2E9Q9D5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl2E9Q9D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl2E9Q9D5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl2E9Q9D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl2E9Q9D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl2E9Q9D5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl2E9Q9D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl2E9Q9D5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl2E9Q9D5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl2E9Q9D5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabl2E9Q9D5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl2E9Q9D5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl2E9Q9D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl2E9Q9D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl2E9Q9D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms