Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE0

Rhox2f, MCG113260, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2fA2ANE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox2fA2ANE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rhox2fA2ANE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rhox2fA2ANE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rhox2fA2ANE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rhox2fA2ANE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox2fA2ANE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rhox2fA2ANE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox2fA2ANE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhox2fA2ANE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhox2fA2ANE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rhox2fA2ANE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rhox2fA2ANE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rhox2fA2ANE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rhox2fA2ANE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rhox2fA2ANE0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rhox2fA2ANE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rhox2fA2ANE0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rhox2fA2ANE0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rhox2fA2ANE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rhox2fA2ANE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhox2fA2ANE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rhox2fA2ANE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rhox2fA2ANE0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rhox2fA2ANE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhox2fA2ANE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhox2fA2ANE0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rhox2fA2ANE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhox2fA2ANE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhox2fA2ANE0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rhox2fA2ANE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rhox2fA2ANE0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rhox2fA2ANE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rhox2fA2ANE0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rhox2fA2ANE0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rhox2fA2ANE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rhox2fA2ANE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rhox2fA2ANE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rhox2fA2ANE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rhox2fA2ANE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rhox2fA2ANE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rhox2fA2ANE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rhox2fA2ANE0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rhox2fA2ANE0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rhox2fA2ANE0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhox2fA2ANE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhox2fA2ANE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhox2fA2ANE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhox2fA2ANE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rhox2fA2ANE0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhox2fA2ANE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhox2fA2ANE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhox2fA2ANE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox2fA2ANE0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhox2fA2ANE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhox2fA2ANE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhox2fA2ANE0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rhox2fA2ANE0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhox2fA2ANE0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhox2fA2ANE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox2fA2ANE0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhox2fA2ANE0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhox2fA2ANE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhox2fA2ANE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rhox2fA2ANE0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhox2fA2ANE0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhox2fA2ANE0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhox2fA2ANE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhox2fA2ANE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhox2fA2ANE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhox2fA2ANE0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhox2fA2ANE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhox2fA2ANE0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhox2fA2ANE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhox2fA2ANE0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhox2fA2ANE0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhox2fA2ANE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhox2fA2ANE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhox2fA2ANE0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhox2fA2ANE0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhox2fA2ANE0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhox2fA2ANE0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhox2fA2ANE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhox2fA2ANE0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhox2fA2ANE0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox2fA2ANE0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox2fA2ANE0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhox2fA2ANE0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhox2fA2ANE0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox2fA2ANE0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhox2fA2ANE0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhox2fA2ANE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox2fA2ANE0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhox2fA2ANE0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhox2fA2ANE0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox2fA2ANE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox2fA2ANE0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhox2fA2ANE0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhox2fA2ANE0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rhox2fA2ANE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms