Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nup62clA2AG10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Nup62clA2AG10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nup62clA2AG10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup62clA2AG10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nup62clA2AG10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Nup62clA2AG10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup62clA2AG10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nup62clA2AG10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup62clA2AG10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nup62clA2AG10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup62clA2AG10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup62clA2AG10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup62clA2AG10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup62clA2AG10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nup62clA2AG10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nup62clA2AG10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup62clA2AG10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup62clA2AG10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nup62clA2AG10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nup62clA2AG10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup62clA2AG10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Nup62clA2AG10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup62clA2AG10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup62clA2AG10 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup62clA2AG10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup62clA2AG10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup62clA2AG10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup62clA2AG10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nup62clA2AG10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup62clA2AG10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup62clA2AG10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup62clA2AG10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup62clA2AG10 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup62clA2AG10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup62clA2AG10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup62clA2AG10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup62clA2AG10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup62clA2AG10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup62clA2AG10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup62clA2AG10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup62clA2AG10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup62clA2AG10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup62clA2AG10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup62clA2AG10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup62clA2AG10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup62clA2AG10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup62clA2AG10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup62clA2AG10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nup62clA2AG10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup62clA2AG10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup62clA2AG10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup62clA2AG10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup62clA2AG10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup62clA2AG10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup62clA2AG10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup62clA2AG10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup62clA2AG10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup62clA2AG10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup62clA2AG10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup62clA2AG10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup62clA2AG10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup62clA2AG10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup62clA2AG10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup62clA2AG10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup62clA2AG10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup62clA2AG10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup62clA2AG10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup62clA2AG10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup62clA2AG10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup62clA2AG10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup62clA2AG10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup62clA2AG10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup62clA2AG10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup62clA2AG10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup62clA2AG10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup62clA2AG10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup62clA2AG10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup62clA2AG10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup62clA2AG10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup62clA2AG10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup62clA2AG10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup62clA2AG10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup62clA2AG10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup62clA2AG10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup62clA2AG10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup62clA2AG10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup62clA2AG10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup62clA2AG10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup62clA2AG10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup62clA2AG10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup62clA2AG10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup62clA2AG10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup62clA2AG10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup62clA2AG10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms