Protein–RNA interactions for Protein: A2AEP0

Obp1b, Odorant-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obp1bA2AEP0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Obp1bA2AEP0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Obp1bA2AEP0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Obp1bA2AEP0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Obp1bA2AEP0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Obp1bA2AEP0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Obp1bA2AEP0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Obp1bA2AEP0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Obp1bA2AEP0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Obp1bA2AEP0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Obp1bA2AEP0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Obp1bA2AEP0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Obp1bA2AEP0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Obp1bA2AEP0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Obp1bA2AEP0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Obp1bA2AEP0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Obp1bA2AEP0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Obp1bA2AEP0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Obp1bA2AEP0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Obp1bA2AEP0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Obp1bA2AEP0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Obp1bA2AEP0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Obp1bA2AEP0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Obp1bA2AEP0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Obp1bA2AEP0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Obp1bA2AEP0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Obp1bA2AEP0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Obp1bA2AEP0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Obp1bA2AEP0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Obp1bA2AEP0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Obp1bA2AEP0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Obp1bA2AEP0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Obp1bA2AEP0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Obp1bA2AEP0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Obp1bA2AEP0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Obp1bA2AEP0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Obp1bA2AEP0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Obp1bA2AEP0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Obp1bA2AEP0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Obp1bA2AEP0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Obp1bA2AEP0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Obp1bA2AEP0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Obp1bA2AEP0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Obp1bA2AEP0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Obp1bA2AEP0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Obp1bA2AEP0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Obp1bA2AEP0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Obp1bA2AEP0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obp1bA2AEP0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obp1bA2AEP0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Obp1bA2AEP0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Obp1bA2AEP0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Obp1bA2AEP0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Obp1bA2AEP0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Obp1bA2AEP0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Obp1bA2AEP0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Obp1bA2AEP0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Obp1bA2AEP0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Obp1bA2AEP0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Obp1bA2AEP0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Obp1bA2AEP0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Obp1bA2AEP0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Obp1bA2AEP0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Obp1bA2AEP0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Obp1bA2AEP0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Obp1bA2AEP0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Obp1bA2AEP0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Obp1bA2AEP0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Obp1bA2AEP0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Obp1bA2AEP0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Obp1bA2AEP0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Obp1bA2AEP0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Obp1bA2AEP0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Obp1bA2AEP0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Obp1bA2AEP0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Obp1bA2AEP0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Obp1bA2AEP0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Obp1bA2AEP0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Obp1bA2AEP0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Obp1bA2AEP0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Obp1bA2AEP0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Obp1bA2AEP0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Obp1bA2AEP0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Obp1bA2AEP0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms