Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-6.08□□□□□ -3.38
POLR1AO95602 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-6.08□□□□□ -3.38
POLR1AO95602 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
POLR1AO95602 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
POLR1AO95602 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
POLR1AO95602 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
POLR1AO95602 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
POLR1AO95602 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-6.22□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-6.22□□□□□ -3.4
POLR1AO95602 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-6.22□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
POLR1AO95602 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-6.29□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-6.29□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
POLR1AO95602 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-6.4□□□□□ -3.43
POLR1AO95602 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-6.44□□□□□ -3.44
POLR1AO95602 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-6.45□□□□□ -3.44
POLR1AO95602 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.45
POLR1AO95602 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.45
POLR1AO95602 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
POLR1AO95602 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
POLR1AO95602 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
POLR1AO95602 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
POLR1AO95602 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
POLR1AO95602 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
POLR1AO95602 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-6.64□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
POLR1AO95602 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-6.7□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
POLR1AO95602 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
POLR1AO95602 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-6.74□□□□□ -3.49
POLR1AO95602 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
POLR1AO95602 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
POLR1AO95602 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
POLR1AO95602 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
POLR1AO95602 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
POLR1AO95602 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
POLR1AO95602 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-6.84□□□□□ -3.51
POLR1AO95602 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
POLR1AO95602 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
POLR1AO95602 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
POLR1AO95602 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
POLR1AO95602 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
POLR1AO95602 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-6.97□□□□□ -3.53
POLR1AO95602 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
POLR1AO95602 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
POLR1AO95602 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
POLR1AO95602 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
POLR1AO95602 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-7.04□□□□□ -3.54
POLR1AO95602 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
POLR1AO95602 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
POLR1AO95602 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
POLR1AO95602 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
POLR1AO95602 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-7.18□□□□□ -3.56
POLR1AO95602 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-7.22□□□□□ -3.57
POLR1AO95602 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
POLR1AO95602 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
POLR1AO95602 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-7.27□□□□□ -3.57
POLR1AO95602 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
POLR1AO95602 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
POLR1AO95602 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-7.33□□□□□ -3.58
POLR1AO95602 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-7.4□□□□□ -3.59
POLR1AO95602 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-7.41□□□□□ -3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms