Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
FAM3DQ96BQ1 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
FAM3DQ96BQ1 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
FAM3DQ96BQ1 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
FAM3DQ96BQ1 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.6 ms