Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.96□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ITGB3BPQ13352 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
ITGB3BPQ13352 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.32□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
ITGB3BPQ13352 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ITGB3BPQ13352 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ITGB3BPQ13352 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ITGB3BPQ13352 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
ITGB3BPQ13352 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms