Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPRTO14522 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRTO14522 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRTO14522 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRTO14522 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRTO14522 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRTO14522 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms