Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMG1Q96Q15 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SMG1Q96Q15 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SMG1Q96Q15 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
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