Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms