Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
CENPFP49454 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
CENPFP49454 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
CENPFP49454 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
CENPFP49454 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-6.51□□□□□ -3.45
CENPFP49454 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
CENPFP49454 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
CENPFP49454 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-6.54□□□□□ -3.46
CENPFP49454 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-6.54□□□□□ -3.46
CENPFP49454 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-6.55□□□□□ -3.46
CENPFP49454 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-6.55□□□□□ -3.46
CENPFP49454 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-6.55□□□□□ -3.46
CENPFP49454 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-6.55□□□□□ -3.46
CENPFP49454 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-6.57□□□□□ -3.46
CENPFP49454 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-6.57□□□□□ -3.46
CENPFP49454 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPFP49454 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPFP49454 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
CENPFP49454 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
CENPFP49454 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
CENPFP49454 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
CENPFP49454 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
CENPFP49454 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
CENPFP49454 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-6.64□□□□□ -3.47
CENPFP49454 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
CENPFP49454 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
CENPFP49454 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
CENPFP49454 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
CENPFP49454 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-6.67□□□□□ -3.48
CENPFP49454 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
CENPFP49454 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPFP49454 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPFP49454 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPFP49454 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPFP49454 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
CENPFP49454 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
CENPFP49454 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
CENPFP49454 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
CENPFP49454 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
CENPFP49454 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
CENPFP49454 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
CENPFP49454 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-6.74□□□□□ -3.49
CENPFP49454 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-6.74□□□□□ -3.49
CENPFP49454 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-6.75□□□□□ -3.49
CENPFP49454 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
CENPFP49454 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
CENPFP49454 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-6.77□□□□□ -3.49
CENPFP49454 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
CENPFP49454 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
CENPFP49454 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
CENPFP49454 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.5
CENPFP49454 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.5
CENPFP49454 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
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CENPFP49454 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
CENPFP49454 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-6.81□□□□□ -3.5
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CENPFP49454 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
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CENPFP49454 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
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CENPFP49454 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
CENPFP49454 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
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CENPFP49454 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-6.86□□□□□ -3.51
CENPFP49454 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-6.86□□□□□ -3.51
CENPFP49454 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-6.86□□□□□ -3.51
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CENPFP49454 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-6.89□□□□□ -3.51
CENPFP49454 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-6.89□□□□□ -3.51
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CENPFP49454 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
CENPFP49454 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
CENPFP49454 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
CENPFP49454 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
CENPFP49454 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
CENPFP49454 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-6.93□□□□□ -3.52
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CENPFP49454 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-6.94□□□□□ -3.52
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CENPFP49454 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
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CENPFP49454 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-7.01□□□□□ -3.53
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CENPFP49454 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
CENPFP49454 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
CENPFP49454 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.54
CENPFP49454 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.54
CENPFP49454 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-7.04□□□□□ -3.54
CENPFP49454 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-7.04□□□□□ -3.54
CENPFP49454 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-7.05□□□□□ -3.54
CENPFP49454 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-7.06□□□□□ -3.54
CENPFP49454 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-7.06□□□□□ -3.54
CENPFP49454 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-7.06□□□□□ -3.54
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