Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CEP290O15078 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CEP290O15078 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CEP290O15078 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CEP290O15078 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CEP290O15078 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CEP290O15078 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CEP290O15078 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CEP290O15078 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.65□□□□□ -2.99
CEP290O15078 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
CEP290O15078 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
CEP290O15078 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
CEP290O15078 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
CEP290O15078 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CEP290O15078 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CEP290O15078 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CEP290O15078 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CEP290O15078 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CEP290O15078 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CEP290O15078 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CEP290O15078 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CEP290O15078 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CEP290O15078 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
CEP290O15078 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
CEP290O15078 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CEP290O15078 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CEP290O15078 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CEP290O15078 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CEP290O15078 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
CEP290O15078 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
CEP290O15078 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CEP290O15078 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CEP290O15078 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
CEP290O15078 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CEP290O15078 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CEP290O15078 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CEP290O15078 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
CEP290O15078 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CEP290O15078 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CEP290O15078 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CEP290O15078 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
CEP290O15078 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
CEP290O15078 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CEP290O15078 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
CEP290O15078 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
CEP290O15078 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
CEP290O15078 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
CEP290O15078 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
CEP290O15078 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
CEP290O15078 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CEP290O15078 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CEP290O15078 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
CEP290O15078 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CEP290O15078 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CEP290O15078 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CEP290O15078 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
CEP290O15078 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CEP290O15078 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CEP290O15078 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CEP290O15078 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CEP290O15078 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CEP290O15078 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CEP290O15078 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
CEP290O15078 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
CEP290O15078 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CEP290O15078 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CEP290O15078 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms