Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRXP46100 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRXP46100 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRXP46100 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRXP46100 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRXP46100 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRXP46100 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRXP46100 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRXP46100 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRXP46100 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRXP46100 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRXP46100 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRXP46100 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRXP46100 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRXP46100 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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