Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.27□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.31□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.37□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.27
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-5.42□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-5.5□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
NRXN3Q9Y4C0 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.3 ms