Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.75□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SCN11AQ9UI33 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-3.81□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SCN11AQ9UI33 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.85□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
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