Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATRQ13535 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATRQ13535 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATRQ13535 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATRQ13535 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATRQ13535 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ATRQ13535 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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