Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.7 ms