Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SCN9AQ15858 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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