Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN5AQ14524 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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