Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXE3Q13461 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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FOXE3Q13461 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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