Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPREP23469 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPREP23469 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPREP23469 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPREP23469 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPREP23469 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPREP23469 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPREP23469 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPREP23469 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPREP23469 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPREP23469 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPREP23469 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPREP23469 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPREP23469 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPREP23469 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPREP23469 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPREP23469 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPREP23469 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPREP23469 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPREP23469 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPREP23469 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPREP23469 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPREP23469 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPREP23469 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPREP23469 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPREP23469 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPREP23469 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPREP23469 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPREP23469 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPREP23469 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPREP23469 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PTPREP23469 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPREP23469 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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PTPREP23469 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPREP23469 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPREP23469 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPREP23469 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPREP23469 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPREP23469 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPREP23469 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPREP23469 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPREP23469 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPREP23469 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPREP23469 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPREP23469 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPREP23469 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPREP23469 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPREP23469 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPREP23469 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPREP23469 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPREP23469 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPREP23469 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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PTPREP23469 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPREP23469 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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PTPREP23469 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPREP23469 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPREP23469 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPREP23469 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPREP23469 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPREP23469 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPREP23469 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPREP23469 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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