Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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CCDC142Q17RM4 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
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CCDC142Q17RM4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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CCDC142Q17RM4 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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CCDC142Q17RM4 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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CCDC142Q17RM4 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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CCDC142Q17RM4 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC142Q17RM4 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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