Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KARSQ15046 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KARSQ15046 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KARSQ15046 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KARSQ15046 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KARSQ15046 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KARSQ15046 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KARSQ15046 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KARSQ15046 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KARSQ15046 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KARSQ15046 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
KARSQ15046 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KARSQ15046 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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