Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF9Q13886 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
KLF9Q13886 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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