Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EPHB4P54760 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EPHB4P54760 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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