Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RDH8Q9NYR8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
RDH8Q9NYR8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RDH8Q9NYR8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RDH8Q9NYR8 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms