Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SEH1LQ96EE3 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEH1LQ96EE3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEH1LQ96EE3 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.6 ms