Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN19Q8N6F1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms