Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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