Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC2Q13487 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC2Q13487 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC2Q13487 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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